数据与细胞状态
从单细胞图谱与表达数据出发,探索细胞状态的表征与基础模型。
03 / CELL STATES & PERTURBATIONS
围绕细胞状态表征、扰动响应预测与模型评测,连接数据、模型和研究方法。
从单细胞图谱与表达数据出发,探索细胞状态的表征与基础模型。
关注基因与药物扰动,连接实验数据、分析工具与响应预测方法。
结合具体任务查看基准、数据划分与泛化表现,理解模型可以回答哪些问题。
公开单细胞 RNA 数据入口,支持按细胞和基因查询,并接入 Python 或 R 分析。
来源 · CZ CELLxGENE 项目查看资源信息 →连接生物数据、AI 模型和任务基准,提供模型探索、使用与评估的官方入口。
来源 · Biohub · Virtual Cells Platform查看资源信息 →基于预训练模型开展单细胞分析,探索细胞表征、注释与扰动预测等任务。
来源 · Wang Lab · scGPT 项目查看资源信息 →分析单细胞扰动实验,整理数据与元信息,比较细胞对遗传或药物等扰动的响应。
来源 · scverse · Pertpy 项目查看资源信息 →此专题暂未发布文章。后续解读将在核实后补充。