数据库
UniProt
从蛋白序列、功能注释与标识符映射出发，连接结构和相关生物学信息。
来源 · UniProt 联盟核对于
DISCOVER / 02
找到下一步需要的工具。
从官方来源筛选的生信数据库、工具与工作流。按任务探索，收藏常用入口。
13 个资源
数据库
RCSB PDB
检索、浏览与下载生物大分子三维结构，结合实验信息理解结构证据。
来源 · RCSB PDB核对于
数据库
AlphaFold DB
查询蛋白质预测结构与置信度信息，为结构探索提供可下载的模型。
来源 · Google DeepMind · EMBL-EBI核对于
分析工具
ColabFold
通过笔记本或本地批处理运行蛋白结构预测，衔接序列搜索与模型生成。
来源 · ColabFold 项目核对于
分析工具
Scanpy
基于 Python 的单细胞分析工具，覆盖预处理、可视化、聚类与差异表达分析。
来源 · scverse · Scanpy 项目核对于
研究平台
Bioconductor
围绕 R 语言的生物数据分析生态，提供分析包、注释资源和可复现工作流。
来源 · Bioconductor 项目核对于
数据库
Ensembl
浏览基因组、基因注释、变异与比较基因组信息，连接基因坐标和功能研究。
来源 · EMBL-EBI · Ensembl 项目核对于
数据库
CZ CELLxGENE Census
公开单细胞 RNA 数据入口，支持按细胞和基因查询，并接入 Python 或 R 分析。
来源 · CZ CELLxGENE 项目核对于
研究平台
Virtual Cells Platform
连接生物数据、AI 模型和任务基准，提供模型探索、使用与评估的官方入口。
来源 · Biohub · Virtual Cells Platform核对于
分析工具
scGPT
基于预训练模型开展单细胞分析，探索细胞表征、注释与扰动预测等任务。
来源 · Wang Lab · scGPT 项目核对于
分析工具
Pertpy
分析单细胞扰动实验，整理数据与元信息，比较细胞对遗传或药物等扰动的响应。
来源 · scverse · Pertpy 项目核对于
工作流
nf-core
由社区维护的 Nextflow 流程与组件，帮助组织可移植、可复现的生信分析。
来源 · nf-core 社区核对于
研究平台
Galaxy
通过网页组织数据分析，记录操作历史并共享数据、结果与工作流。
来源 · Galaxy 社区核对于
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