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RFD4 in brief: from protein binding to enzyme catalysis

Three visual summaries of target binding, modification recognition, and single-step catalysis, with results interpreted within each experimental task.

3 min · Chinese body text

UW/IPD Baker团队 × NVIDIA · 2026-10-21

从认准靶点到催化反应,蛋白设计要交的答卷,正在从一张结构图变成实验里的功能。

RFD4来了,这次不只看结构图。

Baker团队与英伟达联合发布RFD4-Proteina,把RFdiffusion与Proteina两条路线合在一起:氨基酸序列与全原子结构一起生成,还能在生成途中反复细化、按目标筛选分支。

最值得看的,是实验里这三件事。

认准靶点。 人TrkA受体任务中,188个受测设计有158个达到亚微摩尔结合,约84%。这是该任务的结果,不是模型对所有靶点的通用成功率。

辨认修饰。 不只认出一段肽,还能区分组蛋白H3相邻位置的磷酸化。另一组实验则通过设计蛋白周围的空间,限制糖链的后续加工。

参与药物合成。 研究者瞄准抗HIV药物lenacapavir合成中的一个酰胺成键步骤。67个受测设计中,4个显示明确活性;最佳设计对目标S-胺的终点转化率为79%。这是一步反应的概念验证,不是AI已经造出整款药。

我们更关心的变化是:设计要求不再止于“折得像”,还要落到“认得准、催得动”。

代码与权重已公开,完整研究稿含补充材料共116页。官网还能直接旋转查看设计模型,链接附在文末。

研究稿尚未同行评审,以上为作者报告的结果。

三图速览

RFD4-Proteina 四类功能设计示意,结构来自官方展示。
RFD4-Proteina 四类功能设计示意,结构来自官方展示。 点击图片查看原尺寸。
TrkA 任务的 158/188 结合统计及人鼠选择性示例;不代表所有靶点。
TrkA 任务的 158/188 结合统计及人鼠选择性示例;不代表所有靶点。 点击图片查看原尺寸。
酰胺成键任务中 4/67 个设计显示活性,最佳设计达到 79% 终点转化率;不是完整药物合成。
酰胺成键任务中 4/67 个设计显示活性,最佳设计达到 79% 终点转化率;不是完整药物合成。 点击图片查看原尺寸。

论文信息

Title Biomolecular design through latent reasoning with RFD4-Proteina
Source 官方研究稿,尚未同行评审
Announced 2026-10-21
URL https://rfd4-proteina.org/

来源与资源

原文、结构展示与项目 · 代码 · 权重

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