ColabFold ↗
通过笔记本或本地批处理运行蛋白结构预测，衔接序列搜索与模型生成。
来源 · ColabFold 项目查看资源信息 →04 / TOOLS & METHODS
工具与工作流
发现分析工具与可复现流程，从资源选择走向实际使用。
从这些资源开始
筛选此方向 →Scanpy ↗
基于 Python 的单细胞分析工具，覆盖预处理、可视化、聚类与差异表达分析。
来源 · scverse · Scanpy 项目查看资源信息 →Bioconductor ↗
围绕 R 语言的生物数据分析生态，提供分析包、注释资源和可复现工作流。
来源 · Bioconductor 项目查看资源信息 →Virtual Cells Platform ↗
连接生物数据、AI 模型和任务基准，提供模型探索、使用与评估的官方入口。
来源 · Biohub · Virtual Cells Platform查看资源信息 →scGPT ↗
基于预训练模型开展单细胞分析，探索细胞表征、注释与扰动预测等任务。
来源 · Wang Lab · scGPT 项目查看资源信息 →Pertpy ↗
分析单细胞扰动实验，整理数据与元信息，比较细胞对遗传或药物等扰动的响应。
来源 · scverse · Pertpy 项目查看资源信息 →nf-core ↗
由社区维护的 Nextflow 流程与组件，帮助组织可移植、可复现的生信分析。
来源 · nf-core 社区查看资源信息 →Galaxy ↗
通过网页组织数据分析，记录操作历史并共享数据、结果与工作流。
来源 · Galaxy 社区查看资源信息 →相关解读
此专题暂未发布文章。后续解读将在核实后补充。